14 sierpnia 1775 r. dekretem rosyjskiej cesarzowej Katarzyny II Sicz Zaporoska została ostatecznie zniesiona. Po zjednoczeniu znacznej części Małorusi z państwem rosyjskim w 1654 r. wojska zaporoskie uzyskały przywileje, którymi cieszyły się inne rosyjskie wojska kozackie. Ważną rolę odegrali Kozacy zaporoscy. Kozacy bronili południowych granic Rosji, odgrywali znaczącą rolę w wojnach z Chanatem Krymskim i Imperium Osmańskim. Dlatego Kozacy zachowali pewną autonomię wobec rządu centralnego. Kozacy udzielili jednak schronienia ukrywającym się na Siczy Zaporoskiej uciekinierom przed prześladowaniami władz carskich. Ponadto istniało niebezpieczeństwo buntu przeciwko centrum, sojuszu z zewnętrznymi wrogami Rosji.
Tak więc w 1709 r. ataman koszerny Kost Gordienko i hetman Mazepa podpisali sojusz sojuszniczy z królem szwedzkim Karolem XII. Sicz Zaporoska przyłączyła się do sojuszu Mazepy i Karola przeciwko Rosji. Doszło do kilku starć między Kozakami a wojskami rosyjskimi. Piotr rozkazuje księciu Mieńszikowowi przenieść trzy pułki z Kijowa na Sicz pod dowództwem pułkownika Jakowlewa, aby „zniszczyć całe gniazdo buntowników”. Sicz została zniszczona, a później Piotr nie pozwolił na jej odbudowę. Kozacy założyli na ziemiach kontrolowanych przez Turków i Tatarów Krymskich Kamenską (1709-1711) i Aleszkowską Sicz (1711-1734). Nie trwały jednak długo.
W 1733 r., kiedy po wybuchu wojny między Imperium Rosyjskim a Turcją chan Krymski nakazał Kozakom Siczy Aloszkowskiej udać się na granicę rosyjską, generał Wiejsbach (w tym czasie zajmował się budową ukraińskiego linii fortec) wręczył Kozakom certyfikat w układzie Krasny Kut, 4 wiorsty ze starej Siczy Czertołyckiej. Kozacy otrzymali list od cesarzowej Anny Ioannovny o ułaskawieniu i przyjęciu obywatelstwa rosyjskiego. W rezultacie powstała Nowa Sicza (Podpolnenskaya lub Pidpilnyanskaya), istniała do ostatecznego zniszczenia Siczy Zaporoskiej w 1775 roku.
Nowa Sicz bardzo różniła się od starej. Stała się nie tylko organizmem wojskowym, ale gospodarczym, politycznym. Kozacy otrzymali pełny samorząd i ziemie do osadnictwa. Pojawiły się nowe konstrukcje - "palanki". Były to swego rodzaju „prowincje” Sicz w Samarze, Miusie, Bugu, Inguletach itp. Każdą palanką rządził podległy Kosh pułkownik, esaul i urzędnik. To właśnie ziemia stała się dla Kozaków głównym źródłem dochodu, a nie pensja. W pobliżu Sicz osiedlali się „zimowicy” – żonaci Kozacy, nie mieli ani prawa do głosowania w sejmie, ani do bycia wybieranymi na urząd i byli zobowiązani do płacenia „dymu” do skarbca Sicz, czyli rodzaj podatku rodzinnego. Oprócz kozaków żonatych zaczęto tak nazywać cudzoziemców (głównie chłopów, biedaków szukających lepszego życia), pochodzących z Wielkopolski, prawobrzeżnej Ukrainy i posiadłości tureckich. Nie byli uważani za Kozaków, ale byli poddanymi Sicz, dostarczali żywność i płacili 1 rubel rocznie. Mieszkańcy Siczy utrzymywali się z rybołówstwa, łowiectwa, hodowli bydła, rolnictwa i handlu. Brygadzista otrzymywał dochody z ceł od importu towarów, własności ziemi, pastwisk, rybołówstwa.
Kozacy przestrzegali tylko własnych praw, w drobnych sprawach sądzono ich w palankitach, w sprawach znaczących - w koszewoju. Sprawcę można było przekazać władzom cesarskim, ale najczęściej sami byli karani, aż do kary śmierci. Sicz szybko stała się jednym z kwitnących regionów Rosji. Palankiety pokrywały wsie i zagrody.
Jednak na Siczy istniały również poważne sprzeczności między brygadzistą a golotem. Tak więc rząd carski niemal natychmiast naruszył obowiązek wydawania rocznie Sicz 20 tysięcy rubli pensji. Już w 1738 r. zaczęli dawać tylko 4-7 tys.. Resztę pieniędzy kazano wypłacić z funduszy wojskowych, ale były puste. W rezultacie władze zaczęły oszukiwać - rozdawały "publicznie" 4 tysiące rubli, resztę pieniędzy potajemnie przekazywano starostom, wodzom kurenów. Szybko jednak dowiedzieli się o tym Kozacy: w 1739 r. koszewnik Tukal i starszyzna obalili, pobili i splądrowali majątek (koszewicz został tak ciężko pobity, że wkrótce zmarł). W przyszłości brygadziści nadal się bogacili. W szczególności koshevoy Kalnyshevsky sprzedał kiedyś 14 tysięcy koni ze swoich stad. Zwykli Kozacy byli w biedzie, wszystkie zasiłki szły na korzyść brygadzisty.
Zwykli Kozacy pracowali dla brygadzisty, łowili ryby, rozwijało się też „gajdamastwo”, czyli rabunek. W dolnym biegu Bugu zbiegały się granice Rosji, Turcji i Polski, co pomogło ukryć się po grabieżach. W latach pięćdziesiątych i sześćdziesiątych XVII wieku Gaidamache stało się prawdziwą katastrofą w tym regionie. Ludzie po prostu bali się podróżować po nadbużańskim. Skargi na Kozaków napływały z Turcji i Polski. Instrukcje władz cesarskich po prostu „zjeżdżały na hamulce”. Handel był bardzo dochodowy, a wielu brygadzistów i administrację palanques było w jego udziale. Kiedy w 1760 r. pod naciskiem władz rosyjskich Koshevoy Beletsky zorganizował napad na rabusiów, tylko 40 osób udało się aresztować. I nawet wtedy atamani kureni zabronili ich rozdawać, rozłożyli na kureny i po pokucie wypuścili. Gdy rosyjskie dowództwo wojskowe ustanowiło patrolowanie granicy z regularną kawalerią i kozakami podmiejskimi, rozpoczęły się zbrojne potyczki.
Powstała kolejna przyczyna konfliktu Siczy z władzami centralnymi. W tym okresie nastąpił aktywny rozwój pustych wcześniej terenów Dzikiego Pola, a Kozacy zaczęli bronić swoich „prawowitych” ziem. Swoje roszczenia oparli na fałszerstwie - "kopii listu Stefana Batorego", który rzekomo dał im ziemię w pobliżu miasta Czygirin, wzdłuż Samary i Południowego Bugu, lewego brzegu Dniepru do Dońca Siewierskiego. A ponieważ rosyjscy władcy, poczynając od Aleksieja Michajłowicza, potwierdzili „byłe wolności zaporoskie”, samo słowo „wolności” zaczęto interpretować w sensie terytorialnym. Kozacy zaporoscy, broniąc swoich „prawnych” ziem, nie poprzestali na użyciu siły. Spalili kilka nowych osad, rozproszyli wieśniaków. W rezultacie Kozacy po prostu stali się bezczelni, rzucając wyzwanie rządowi centralnemu. Jednak pod rządami Elżbiety i hetmana Razumowskiego uszło im to na sucho.
Za czasów Katarzyny II sytuacja się zmieniła. Poważnie zajęła się sprawami luźnej Ukrainy. W 1763 r. hetman Razumowski, który wspomniał o dziedzicznym statusie swojego stanowiska, zrezygnował „z własnej woli”. Odtworzono Małoruskie Kolegium. Jej prezesem został generał P. A. Rumyantsev. Znalazł obraz całkowitego upadku na Ukrainie. Elita wojskowa, która rządziła w imieniu Razumowskiego, całkowicie wymknęła się spod kontroli. Majstrowie zamienili się w wszechmocnych szlachciców, prawdziwych lokalnych „książąt”. Doszli do tego, że walczyli ze sobą, rzucając wyzwanie ziemi, uzbrajając Kozaków i chłopów. Ludność została poddana bezlitosnej eksploatacji. Zwykli Kozacy albo zbankrutowali, stając się robotnikami rolnymi, albo zajmowali się rolnictwem osobistym. Dekret z 1721 r. o zachęcaniu do destylacji kozackiej miał negatywny wpływ na wojska. Wielu ludzi zapiło się na śmierć, inni pili swoje działki. W rezultacie armia małorosyjska uległa rozkładowi. Rumiancew nie mógł nawet zorganizować poczty: bogaci nie chcieli służyć, biedni nie mieli okazji.
Konieczne było podjęcie działań w celu przywrócenia zdolności bojowej miejscowych wojsk. W 1764 r. zaczęli przekształcać oddziały kozackie w regularne. Z pułków ukraińskich utworzono 5 huzarów: Czarny, Żółty, Niebieski, Serbski i Ugorski. Ponadto utworzono cztery pułki pikinerskie (Elisavetgradsky, Dneprovsky, Donieck i Lugansky). Później utworzono kilka kolejnych pułków husarskich, a Landmilicja została zreorganizowana w jednostki piechoty. W sumie Ukraina musiała stracić swój specjalny status i zrównać się z innymi rosyjskimi prowincjami. Siedzenie w tych planach było poważną przeszkodą.
Zwrócono również uwagę na „państwo w państwie” – Sicz Zaporoska. W 1764 r. Kosz został podporządkowany Małoruskiemu Kolegium. Administracji Zaporoża przypisuje się zaprzestanie wyborów. Kozacy byli oburzeni i wbrew zaleceniom przeprowadzili nowe wybory, wybierając Kanyszewskiego na koszewskiego. Nowy koszowew udał się do Petersburga bez pozwolenia, by domagać się bezpośredniego podporządkowania Kolegium Zagranicznego i poruszyć kwestię „legalnych” ziem zaporoskich. Rumiancew zasugerował, by cesarzowa aresztowała delegatów. Opracowano projekt reformy Sicz. Jednak Katarzyna nie podjęła twardych środków, zbliżała się nowa wojna z Turcją, nie chcieli komplikować sytuacji na południu. Cesarzowa łaskawie przyjęła delegację. To zainspirowało Kozaków, wracając na Sicz, zaczęli się chwalić, że „przestraszyli” rząd.
W 1767 r. otrzymano donos, że Koshevoy Kalnyshevsky i urzędnik Iwan Globa zgadzają się na negocjacje z sułtanem tureckim, jeśli rząd nie spełni ich żądań. Katarzyna opuściła donos bez konsekwencji, ale los Siczy był już przesądzony. Rozwiązanie problemu odłożono dopiero do końca wojny z Imperium Osmańskim.
Samo przywództwo Sicz pogorszyło jego niepewną sytuację. Nie tylko zakwestionowała władze rosyjskie, ale także nawiązała kontakt z Krymem i Turcją. W przededniu wojny Kozacy otrzymali listy z Bakczysaraju i Stambułu, w których kuszono ich możliwością przejścia na służbę do Turcji, obiecując potrójną pensję. W imieniu sułtana Siczę odwiedził francuski emisariusz Totleben. Kalnyshevsky odmówił Turkom, ale nie przerwał korespondencji. Ponadto pozwolił Totlebenowi rozmawiać z Kozakami i nie zdradził go Rumiancewowi. Wśród mszy kozackiej zaczęło się zamieszanie. Kiedy w grudniu 1768 r. Kozacy otrzymali polecenie rozpoczęcia wojny z Turcją, zbuntowali się. Kalnyshevsky musiał nie tylko stłumić bunt, ale także poprosić o pomoc rosyjski garnizon z oblężenia Nowosieczenskiego. Zamieszki trwały kilka miesięcy, Kozacy opuścili granice, a Tatarzy przedarli się na Ukrainę w styczniu 1769 roku.
W wojnie rosyjsko-tureckiej 1768-1774. Wzięło w nim udział 10 tys. Kozaków (na terytorium Siczy pozostało około 4 tys.). W czasie wojny wykazywały wysokie walory bojowe, wyróżniały się w rozpoznaniu i nalotach oraz odgrywały ważną rolę w bitwach pod Largą i Cahul. Zwycięstwo w tej wojnie było kolejnym powodem eliminacji armii zaporoskiej. Wraz z zawarciem układu Kuczuk-Kainardzhiyskiy Imperium Rosyjskie uzyskało dostęp do Morza Czarnego, utworzono linię obrony Dniepru, Chanat Krymski był na skraju zagłady. Drugi historyczny wróg Rosji, katolicka Polska, utracił władzę, aw 1772 r. nastąpił jej pierwszy rozbiór. Kozacy zaporoscy stracili rolę obrońców południowych granic.
W maju 1775 korpus generała Petera Tekeli został przeniesiony na Sicz. Operacja była bezkrwawa. Starsi, zdając sobie sprawę, że opór jest bezcelowy, wraz z księżmi uspokoili szeregowych Kozaków. Dekretem Katarzyny Sicz Zaporoska została zniesiona. Zwykli Kozacy nie byli prześladowani. Niektórzy pozostali na Ukrainie i osiedlili się we wsiach i miastach. Niektórzy dowódcy otrzymali stopnie oficerskie, brygadziści stali się szlachtą. Tylko trzech Kozaków - Kalnyshevsky, sędzia wojskowy Paweł Gołowaty i urzędnik Globa zostali skazani pod zarzutem zdrady stanu i zesłani do klasztorów. Kalnyshevsky mieszkał w klasztorze Sołowieckim do 112 roku życia i zmarł w 1803 roku, przyjmując godność monastyczną.
Część Kozaków udała się nad Dunaj pod panowanie sułtana tureckiego i powstała Sicza Zadunajska. W 1828 r. Kozacy zadunajscy przeszli na stronę armii rosyjskiej i zostali osobiście ułaskawieni przez cara Mikołaja I. Z nich powstała armia Kozaków Azowskich. W Rosji podczas wojny z Turcją Aleksander Suworow w latach 1787-1788. z kozaków dawnej Siczy i ich potomków zorganizował „Armię Lojalnych Zaporoskich”. W 1790 r. został przekształcony w armię kozacką czarnomorską, a następnie otrzymał tereny lewobrzeżnego Kubania. Kozacy brali czynny udział w wojnie kaukaskiej i innych wojnach Imperium Rosyjskiego.
