W 1985 r. nowym prezydentem Peru został Alan Garcia, przedstawiciel partii apristycznej. Generalnie kontynuował proamerykańską politykę w gospodarce, aw dziedzinie bezpieczeństwa narodowego starał się neutralizować działalność lewicowych ugrupowań radykalnych poprzez utrzymywanie stanu wyjątkowego i tworzenie „szwadronów śmierci”. Pod przywództwem amerykańskich instruktorów utworzono i wyszkolono batalion antyterrorystyczny o nazwie „Sinchis”, który następnie był często oskarżany o masakry i łamanie praw człowieka w Peru. Tymczasem to lata panowania Alana Garcii stały się okresem maksymalnej aktywacji zarówno Sendero Luminoso, jak i Ruchu Rewolucyjnego Tupaca Amaru.
W 1986 r. RDTA połączyła się z Lewicowym Ruchem Rewolucyjnym MIR -Voz Rebelde (Lewicowy Ruch Rewolucyjny - Głos Rebeliantów). Organizacja ta cieszyła się pewnymi wpływami w północnym Peru – w departamentach Ancash, Lambayeque, La Libertad, San Martin, a także w Limie. Miała własną organizację wojskowo-polityczną, Comandos Revolucionarios del Pueblo (Ludowe Dowództwa Rewolucyjne). Połączenie obu organizacji pod przewodnictwem Victora Polay Campos znacznie wzmocniło RDTA i pozwoliło ruchowi na bardziej aktywne działania nie tylko w miastach, ale także na obszarach wiejskich.
Do działań wojskowych poza przestrzenią miejską utworzono Armię Ludową Tupaca Amaru, której bazy aktywiści próbowali rozmieścić w rejonie Pariahuan w departamencie Junin. Tu emitenci zaczęli rozdawać ludności chłopskiej racje żywnościowe i zestawy narzędzi rolniczych, co zdaniem przywódców organizacji powinno podnieść jej popularność w środowisku chłopskim. Chłopstwo było postrzegane jako naturalna baza społeczna organizacji. W 1986 r. emrtiści próbowali rozmieścić zbrojny opór w rejonie Tocache departamentu San Martin, ale była tam potężna grupa maoistów z Sendero Luminoso, która natychmiast zwróciła się przeciwko obecności konkurentów i odmówiła stworzenia jednolitego frontu z RDTA. Według Senderystów jedynym możliwym sposobem było włączenie RDTA do Sendero Luminoso, na co Guevaryści, Emertyści, nie mogli się zgodzić. Tak więc dwie największe lewicowe radykalne organizacje zbrojne w Peru nie mogły znaleźć wspólnego języka. Co więcej, od czasu do czasu dochodziło nawet do starć między bojownikami obu organizacji.
W regionie San Martin, gdzie stanowiska organizacji MIR VR, która stała się częścią RDTA, były wcześniej silne, rozmieszczono 60 bojowników RDTA z Frontu Północno-Wschodniego, z których 30 było członkami RDTA, a 30 byli członkami Lewicowego Ruchu Rewolucyjnego MIR VR. Obóz powstańczy zorganizowali bojownicy w rejonie Pongo de Kainarachi, gdzie w lipcu-wrześniu 1987 r. przeszli trzymiesięczny kurs wojskowo-polityczny. Dowódca Frontu Północno-Wschodniego został osobiście wyznaczony przez sekretarza generalnego RDTA Victora Polay Campos.
W międzyczasie rząd poważnie zintensyfikował represje wobec radykalnych organizacji lewicowych. Na przykład 7 sierpnia 1987 r. agenci Dyrekcji ds. Zwalczania Terroryzmu uprowadzili członka Krajowego Komitetu Wykonawczego RDTA Alberto Galveza Olaechea, a 23 października 1987 r. aresztowali członka Komitetu Centralnego RDTA, Luseo Cumplo Miranda. Działalność organizacji w zubożałych dzielnicach Limy doznała poważnego ciosu, co wpłynęło również na chęć przywódców RDTA do przeniesienia głównych działań organizacji na wieś. 8 października 1987 r. bojownicy RDTA zdobyli miasto Tabalosos w prowincji Lamas. W ten sposób operacja wojskowa „Che Guevara żyje!” 10 dni później, 18 października, grupa bojowników RDTA zdobyła kolejne miasto - Soritor w prowincji Mayobambo. Równolegle bojownicy prowadzili agitację i kampanię propagandową na obszarach wiejskich, wzywając miejscową ludność indyjską do wsparcia RDTA.
Jednak pomimo faktów udanych nalotów na miasta, operacja „Che Guevara żyje!” nie dał pożądanych rezultatów. Dlatego dowództwo RDTA postanowiło przeprowadzić nową operację – „Liberator Tupac Amaru”. Kolumna bojowników licząca 60 osób zaatakowała miasto Huanghui 6 listopada 1987 r. Bojownicy zaatakowali miejski posterunek policji, siedziby Gwardii Cywilnej i Gwardii Republikańskiej oraz miejskie lotnisko. O zmroku bojownicy opuścili Huanghui i przenieśli się do San Jose de Sisa, które zostało schwytane o 4 rano 7 listopada. Policja San Jose de Sis uciekła, więc miasto wpadło w ręce bojowników. 9 listopada zdobyto miasto Senami, a 19 listopada region Chasuta. Wydarzenia te zmusiły rząd peruwiański do ogłoszenia stanu wyjątkowego w departamencie San Martin i przeniesienia tam dodatkowych jednostek wojskowych.
Znikomość sił zbrojnych RDTA nie pozwalała organizacji na utrzymanie zdobytych miast i bezpośrednie starcia zbrojne z jednostkami wojskowymi. Dlatego RDTA stopniowo koncentrowała się na taktyce porywania urzędników i przedsiębiorców dla okupu. Z czasem działalność ta stała się głównym źródłem finansowania organizacji, zaś Sendero Luminoso otrzymało znacznie więcej środków z powiązań z peruwiańskimi kartelami narkotykowymi. Bojownicy trzymali schwytanych przedsiębiorców w specjalnych „więzieniach ludowych” i zwalniali ich po otrzymaniu okupu od krewnych. W przeciwieństwie do Sendero Luminoso, RDTA była mniej podatna na przemoc wobec schwytanych biznesmenów. Dotknięci zwiększoną uwagą guevarystów na moralne i etyczne aspekty rewolucyjnej walki zbrojnej.
Jednak już w 1988 r. w szeregach RDTA zaczęły się pierwsze poważne sprzeczności, które doprowadziły organizację do konieczności zastosowania „represji wewnętrznych”. Ogólnie rzecz biorąc, wśród lewicowych radykalnych organizacji terrorystycznych w Azji i Ameryce Łacińskiej represje wewnętrzne nie były tak rzadkie. W związku z tym znana była Armia Czerwona Japonii, której bojownicy strzelali do swoich towarzyszy za wszelkie „przestępstwa”. W Peru przywództwo pod względem skali represji wewnętrznych należało do Sendero Luminoso. Ale zajęli też miejsce w szeregach RDTA. Pedro Ojeda Zavala kierował grupą opozycjonistów w szeregach Frontu Północno-Wschodniego RDTA. W tej grupie znaleźli się członkowie MIR VR, niezadowoleni z polityki Victora Paula Camposa. Savala został skazany na śmierć i rozstrzelany 30 października 1988 r. W tym samym czasie stracono braci Leoncio Cesar Cuscien Cabrera i Augusto Manuel Cuscien Cabrera. Zostali oskarżeni o „zbrodnię kontrrewolucyjną” – zabójstwo dwóch ich bezpośrednich dowódców i jednego bojownika. 1 czerwca 1988 r. w szpitalu w Limie zastrzelono także ich siostrę Rosę Cuscienne Cabrera, oskarżoną o pracę dla tajnych służb. Represje wewnętrzne nie przyczyniły się do pozytywnego wizerunku organizacji. RDTA zaczęła tracić poparcie i ludność indyjską chłopską po egzekucji lidera Indyjskiego Stowarzyszenia Samoobrony „Ashaninka” Alejandro Calderona. Został oskarżony, że 23 lata temu, w 1965 roku, jako dziecko przekazał policji miejsce pobytu rewolucjonisty Maximo Velando z „Ruchu Lewicowo-Rewolucyjnego”. Calderon został zabity, co wywołało ostrą negatywną reakcję wielu indyjskich chłopów i rozłam między RDTA a organizacją Ashaninka.
17 grudnia 1989 r. patrol wojskowy zabił 48 bojowników RDTA, wpadając na obóz treningowy bojowników. Tak więc kres położono w historii Frontu Północno-Wschodniego organizacji. W tym czasie RDTA była aktywna w centralnych regionach Peru. Tutejsza ludność znajdowała się w trudnej sytuacji ekonomicznej, a przywódcy RDTA liczyli na pozyskanie poparcia chłopów. Centralny region Peru stał się areną nieustannych starć między RDTA a Sendero Luminoso, które niekiedy przybierały formę prawdziwych bitew między dwiema lewicowymi organizacjami radykalnymi. Jednocześnie RDTA poniosła poważne straty w wyniku działań sił rządowych.
W odpowiedzi na działania sił rządowych, 5 maja 1989 r. bojownicy RDTA zdetonowali samochód wypełniony materiałami wybuchowymi w koszarach armii San Martin w Limie, 29 maja 1989 r. ciężarówkę w koszarach Jauha. 9 stycznia 1990 r. samochód generała Enrique Lópeza Albuhara Trinta, byłego ministra obrony Peru, został ostrzelany z karabinów maszynowych. Generał został zabity.
Uważając się za apologetów rewolucyjnej moralności, bojownicy RDTA 31 maja 1989 r. zaatakowali bar w mieście Tarapoto, w którym gromadzili się lokalni homoseksualiści. Sześciu bandytów wpadło do baru i zastrzeliło ośmiu lokalnych transwestytów i homoseksualistów. RDTA natychmiast przyznało się do tej wyprawy, oskarżając władze i policję o współudział w „wadach społecznych” korumpujących peruwiańską młodzież.
Tymczasem rząd nadal podejmował coraz ostrzejsze środki przeciwko terrorystom. 3 lutego 1989 roku w mieście Huancayo został aresztowany sekretarz generalny RDTA Victor Polay Campos. 16 kwietnia 1989 r. w Limie aresztowano jego najbliższego współpracownika, członka kierownictwa RDTA, Miguela Rincona Rincona.
Po aresztowaniu Victora Polay Camposa, Nestor Serpa Kartolini (na zdjęciu) stał się jednym z najwybitniejszych przywódców RDTA. Urodził się 14 sierpnia 1953 roku w rodzinie robotniczej w Limie. W 1978 brał udział w strajku i przejęciu przez pracowników fabryki włókienniczej Cromotex. Na początku lat osiemdziesiątych. Nestor Serpa dołączył do RDTA i wkrótce stał się jednym z najwybitniejszych bojowników, a następnie przywódcą ruchu. W 1985 wyjechał do Kolumbii, gdzie dowodził oddziałem Leoncio Prado, który był w sojuszu z kolumbijskim M-19. Po powrocie do Peru i aresztowaniu Victora Polay Campos Nestor Serpa Kartolini szybko wspiął się na szczyt organizacji.
Alberto Fujimori, który zastąpił Alana Garcię na stanowisku prezydenta Peru w 1990 roku, zintensyfikował działania rządu na rzecz zwalczania lewicowych organizacji terrorystycznych. Początek lat 90. był okresem poważnych strajków na stanowiskach zarówno RDTA, jak i Sendero Luminoso. Ale jeśli nadawcy byli liczniejsi, to dla rządu RDTA operacje karne były pod wieloma względami śmiertelne. Aby zapewnić uwolnienie aresztowanych towarzyszy, przywódca RDTA Nestor Serpa Kartolini zdecydował się na operację, która stała się najbardziej znaną akcją Ruchu Rewolucyjnego Tupaca Amaru.
17 grudnia 1996 r. oddział powstańczy „Edgard Sanchez”, składający się z 14 bojowników pod dowództwem samego Nestora Serpy Kartoliniego, zajął rezydencję japońskiego ambasadora w Limie. Było to bardzo symboliczne posunięcie, ponieważ prezydent Peru Fujimori jest etnicznym Japończykiem. W chwili zajęcia w budynku rezydencji przebywało około 600 gości, w tym zarówno obcokrajowcy, jak i wysocy rangą urzędnicy peruwiańskiego rządu. Wszyscy zostali wzięci jako zakładnicy przez bojowników RDTA. Nestor Serpa Kartolini zażądał, aby Fujimori uwolnił wszystkich bojowników organizacji, którzy przebywali w więzieniach Peru. Kiedy wielu bojowników zaczęło być uwalnianych, Kartolini uwolnił około dwustu zakładników. Kartolini miał jednak zamiar zwolnić ambasadę dopiero po ostatecznym spełnieniu postawionych wymagań. W miarę upływu miesięcy zagraniczni goście i wysocy rangą urzędnicy nadal byli zakładnikami peruwiańskich rebeliantów.
Wczesną wiosną 1997 roku rezydencja japońskiego ambasadora była nadal pod kontrolą oddziału Nestora Serpy Kartoliniego. Jednak do tego czasu bojownicy uwolnili większość zakładników. W budynku znajdowało się około 70 zakładników i sami emitenci. W końcu prezydent Fujimori postanowił zarządzić szturm na budynek. 22 kwietnia 1997 r. siły specjalne peruwiańskich sił zbrojnych rozpoczęły szturm na rezydencję japońskiego ambasadora. W bitwie, która się wywiązała, zginęli wszyscy działacze RDTA, w tym lider organizacji Nestor Serpa Kartolini. Ze strony sił rządowych zginęło dwóch żołnierzy sił specjalnych. Ponadto zginął jeden zakładnik. W ten sposób zakończyła się najbardziej głośna akcja RDTA, która faktycznie położyła kres historii tej radykalnej lewicowej organizacji.
Pozostali członkowie RDTA próbowali ożywić ruch, a nawet stworzyć nowe przywództwo narodowe, ale te próby poszły na marne. Nie było wśród nich osób z wystarczającym doświadczeniem w konspiracyjnej działalności politycznej, zdolnych do przywrócenia RDTA praktycznie od zera. W prowincji Junin powstała niewielka kolumna rebeliantów, ale w sierpniu-październiku 1998 r., która została całkowicie zniszczona przez jednostki wojsk rządowych. Ruch rewolucyjny Tupaca Amaru przestał istnieć.
Wielu byłych aktywnych bojowników RDTA przebywa obecnie w więzieniach w Peru. Żyje również historyczny przywódca organizacji Victor Polay Campos. Do tej pory nie zbadano wielu epizodów krwawej wojny domowej w kraju w latach 80. - pierwszej połowie lat 90., w której brał udział Ruch Rewolucyjny Tupaca Amaru.
Znacznie pomyślniejsze okazały się losy głównych rywali RDTA o prymat na frontach peruwiańskiej wojny domowej – „Sendero Luminoso”, jeśli to słowo można odnieść do podziemnych organizacji zbrojnych. Oddziały Komunistycznej Partii Peru „Świetlisty Szlak” kontynuują operacje wojskowe w trudno dostępnych rejonach kraju, obozy szkoleniowe nadal funkcjonują, a obrońcy praw człowieka oskarżają nadawców o przymusowe werbowanie nastolatków do swoich formacji partyzanckich. W ten sposób maoistom z „Świetlistego Szlaku” udało się, w przeciwieństwie do RDTA, nie tylko pozyskać poparcie ludności chłopskiej w zacofanych górzystych regionach kraju, ale także utrzymać swoją skuteczność bojową, pomimo licznych operacji antyterrorystycznych przez wojsk rządowych.